Até à data podem encontrar-se sistemas de RFID que funcionam a frequências em redor dos 125 kHz e 13,56 MHz.
- Frequência Baixa ( 9 – 125 kHz ): a sua principal vantagem é a aceitação em todo o mundo, funciona perto dos metais e está amplamente difundida. A distância de leitura é inferior a 1,5 metros, pelo que as aplicações mais habituais são a identificação de animais, barris de cerveja, chaves de automóveis ou livros em bibliotecas.
- Frequência Alta ( 13,56 MHz ): esta frequência também está muito difundida, mas ao contrário da frequência baixa, a alta não funciona perto dos metais. Normalmente utiliza-se em aplicações tais como o movimento de produtos, movimentos de equipamentos de linhas aéreas ou acesso a edifícios.